Praca lekarza medycyny sądowej (zwanego również medykiem sądowym) jest kojarzona najczęściej z wykonywaniem sekcji zwłok oraz orzekaniem przyczyn zgonu. Podczas wykonywania sekcji sądowo-lekarskiej (lub oględzin zewnętrznych), medyk sądowy może pobierać do badań materiał (biologiczny, genetyczny itd.), przeprowadzać niezbędne badania pomagające ustalić przyczynę zgonu, czas  oraz dokładne okoliczności śmierci. Lekarz medycyny sądowej bierze także udział w ekshumacji zwłok oraz przeprowadza ich sekcję. W niektórych przypadkach zajmuje się również oględzinami miejsca ujawnienia zwłok, orzeka zgon osoby, bierze udział w wizjach lokalnych. Do lekarza medycyny sądowej należy również przeprowadzanie badań umożliwiających identyfikację ofiary.

Medycy sądowi pełnią często funkcję biegłych w sądzie i wydają opinię w sprawach cywilnych oraz karnych. Przeprowadzają także badania osób żywych dla potrzeb postępowania cywilnego, karnego i ubezpieczeniowego (obdukcja lekarska), ustalają możliwy przebieg zdarzeń i mechanizm powstania obrażeń, wydają opinię odnośnie kwalifikacji prawnych doznanych obrażeń ciała.